Препарат Паглюферал может вызывать различные побочные эффекты, связанные с действием его компонентов. Со стороны центральной нервной системы наиболее часто отмечаются сонливость, головокружение, заторможенность, атаксия, а также парадоксальное возбуждение, особенно у детей и пожилых. Возможны тошнота, запор, снижение артериального давления, брадикардия. При длительном применении существует риск развития лекарственной зависимости, нарушений функции печени, мегалобластной анемии, остеопороза. К серьезным, но редким реакциям относятся тяжелые кожные синдромы (синдром Стивенса -Джонсона, токсический эпидермальный некролиз ) и угнетение кроветворения. При появлении любых нежелательных реакций необходима консультация врача.