При нанесении крема Скиноклир действующий компонент поглощается кожными покровами, достигая как поверхностного эпидермального слоя, так и более глубокой дермы. Если целостность кожи нарушена, вещество проникает в ткани быстрее по сравнению со здоровыми участками.
Объем препарата, попадающего в общий кровоток, минимален даже при постоянном использовании. Определенная доля азелаиновой кислоты элиминируется через мочевыделительную систему без изменений. Оставшаяся часть подвергается метаболическим превращениям путем бета-окисления — биологического процесса разложения жирных кислот, с образованием дикарбоновых кислот C7 и C5.
Продукты обмена выводятся почками. Официальная инструкция не содержит сведений о степени связывания с плазменными белками, времени полувыведения и особенностях распределения в организме. Прием пищи не оказывает влияния на степень всасывания при наружном использовании препарата.